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哥伦比亚大学开发便携式DNA装置可快速检测有害
编辑:万搏体育   发布时间:2020-08-13 02:09

  亚洲吉普赛蛾以各种重要的植物和树木为食。白松的水泡锈病只能在几年内杀死幼树。但是,仅通过观察树木或货船外部的斑点和颠簸来检测这些破坏性物种的存在并不总是那么容易。

  现在,不列颠哥伦比亚大学开发的一种新的快速DNA检测方法可以在不到两个小时的时间内识别出这些有害生物和病原体,而无需使用复杂的过程或化学药品-与目前将样品发送到实验室的几天相比,可节省大量时间。测试实验室。

  林业教授Richard Hamelin解释说:“有时候,一个地方只是一个地方。”他与UBC,加拿大自然资源公司和加拿大食品检验局的合作者共同设计了该系统。“其他时候,这是一种致命的真菌或一种外来的虫子,已经搭在一个运输集装箱上,有可能破坏当地的公园,森林和农场。因此,您想尽快知道您在看什么,这样您就可以收集更多样本来评估入侵的程度或开始制定行动计划。”

  Hamelin的研究重点在于使用基因组学设计更好的检测和监测方法,以检测威胁森林的入侵性病虫害和病原体。在将近25年的时间里,他一直在寻求一种快速,准确,廉价的DNA测试,该测试即使在没有快速互联网或稳定电源的地方(例如森林)也可以执行。

  他可能找到了。去年在渥太华林业政策制定者的预览中演示了该方法,该方法很简单。将微小的样本(例如叶子或树枝的一部分,或昆虫的部分(例如翅膀和触角))放入一个试管中,然后放入一个小型的电池供电设备(Franklin热循环仪,由费城的Biomeme制造)。设备会检查这些DNA片段是否与目标物种的基因组材料匹配,并生成可在配对智能手机上可视化的信号。

  哈梅林说:“有了这个系统,我们就能以近100%的准确率判断它是否匹配,是否我们正在寻找一种威胁性入侵物种或良性物种。” “我们一次可以分析多达九个来自相同或不同物种的样品,而且它们都非常轻巧-热循环仪仅重1.3公斤-可以放进您的背包并有余地。”

  该方法依赖于PCR测试,该方法目前也是COVID-19的金标准。PCR测试通过将一部分遗传物质放大到可以检测到的水平,可以有效地分析甚至少量的DNA。

  哈默林的研究得到加拿大基因组,卑诗省基因组和魁北克省基因组的支持,并发表在PLOS One上。包括主要作者Arnaud Capron在内的UBC团队对亚洲吉普赛蛾,白松水泡锈病和橡树猝死病原体等物种进行了这种方法的测试,这些物种被列为全球最具破坏力的入侵害虫。

  哈梅林补充说:“我们的林业,农业和园艺业是为加拿大经济贡献数十亿加元的重要产业,因此保护他们免受敌人的侵害至关重要。” “通过早期发现和稳定的监视,我们可以确保将潜在的问题消除在萌芽状态。”

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